More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0968 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  60.33 
 
 		 265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  57.94 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  46.12 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  46.12 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  46.12 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  46.12 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.79 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2833  ABC transporter related  50.23 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  45.71 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.23 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.23 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44.49 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  45.71 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.31 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  44.35 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  44.49 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.91 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  44.26 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.96 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.96 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  45 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  44.49 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  49.09 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.12 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  45.23 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.56 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  42.86 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.25 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  42.86 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  42.04 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.36 
 
 		 673 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  47.08 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.15 
 
 		 668 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  43.09 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  43.09 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  45.38 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.49 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.86 
 
 		 663 aa  198  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  43.69 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  42.34 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.65 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.35 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.29 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  44.3 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  44.49 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.13 
 
 		 659 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  42.21 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  47.11 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.79 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  41.22 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.58 
 
 		 267 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.18 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  46.38 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.66 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.64 
 
 		 669 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.64 
 
 		 669 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  43.04 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.76 
 
 		 669 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  44.9 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.04 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  44.17 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.09 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  40.61 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.64 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.86 
 
 		 657 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  44.35 
 
 		 439 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.67 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.74 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.45 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  45.57 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.96 
 
 		 667 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.49 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.65 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  40.24 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  47.83 
 
 		 245 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  41.2 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  40.17 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.74 
 
 		 253 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.79 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.85 
 
 		 244 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  44.83 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>