157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2745 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2745  fic family protein  100 
 
 		 271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  36.59 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  34.78 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3460  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.36 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.67 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.21 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.21 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  28.21 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  28.64 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.42 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.47 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.77 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.53 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.32 
 
 		 533 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.21 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  30.57 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  26.34 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  28 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.51 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.31 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  28.29 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  27.8 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  25.85 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.73 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.71 
 
 		 505 aa  62  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.94 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.55 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.81 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  38.46 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0774  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.7 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000913684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.32 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.11 
 
 		 508 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  32.76 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.46 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  27.15 
 
 		 502 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.89 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 502 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.82 
 
 		 531 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.95 
 
 		 500 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 388 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.71 
 
 		 488 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 512 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.12 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.5 
 
 		 369 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 		 333 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.76 
 
 		 509 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  24.22 
 
 		 374 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  32.71 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.81 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.54 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.54 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.67 
 
 		 499 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 378 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 417 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  32.2 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.34 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.74 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  32.2 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  25.84 
 
 		 386 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.27 
 
 		 365 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.41 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 393 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.13 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.12 
 
 		 304 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.13 
 
 		 371 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  34.67 
 
 		 331 aa  49.3  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.94 
 
 		 529 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.53 
 
 		 380 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  41.82 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  28.3 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.87 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.7 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.76 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 375 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  37.7 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  41.82 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.7 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.88 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.12 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.04 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  34 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  29.6 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.86 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.56 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  26.34 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.07 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  28.67 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 391 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.03 
 
 		 381 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  29.87 
 
 		 400 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1784  fic family protein  30.38 
 
 		 393 aa  45.4  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0465792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  24.79 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>