88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2596 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2596  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  659    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.59 
 
 		 1000 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  41.1 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  26.98 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  39.13 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  28.46 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.46 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  29.93 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  28.18 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  24.65 
 
 		 995 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 377 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  30.71 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  37.68 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  37.68 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  24.32 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  37.68 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 585 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  32.86 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  37.68 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  32.86 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  32.86 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  32.86 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  41.67 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  32.86 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  32.84 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  35.16 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  35.09 
 
 		 505 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  29.27 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 		 283 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  36.07 
 
 		 488 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  36.07 
 
 		 488 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  35.82 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31.82 
 
 		 239 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 1077 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  31.43 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  28.99 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  30.43 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.87 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  30.86 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  28.99 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2527  hypothetical protein  35.09 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000191168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  34.33 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  30.86 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  30.86 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  28.99 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  28.99 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  28.99 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  21.71 
 
 		 750 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  29.87 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  29.87 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  30 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  23.53 
 
 		 1005 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 		 261 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  40.68 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  24.53 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 487 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  30.43 
 
 		 241 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  28.99 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  28.99 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>