238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0755 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 
491 aa  983    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  24.59 
 
 
443 aa  87  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  24.11 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  23.76 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  25 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  25.54 
 
 
455 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  24.57 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  26.38 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  24.78 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  24.78 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  24.78 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  32.1 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  24.78 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.78 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  24.62 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  24.35 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  24.63 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  22.44 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  32.72 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  25.42 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  22.5 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  24.84 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  23.71 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  24.84 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  22.93 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  23.88 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  30.37 
 
 
507 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  29.83 
 
 
521 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  25.27 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  22.47 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  22.47 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  22.65 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  24.93 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  22.1 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  22.64 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  22.5 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  22.5 
 
 
444 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  22.5 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  25.57 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.75 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1856  Na+/H+ antiporter NhaC  24.24 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1967  Na+/H+ antiporter NhaC  24.24 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  31.43 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  30.38 
 
 
201 aa  67  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  28.09 
 
 
461 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  25.17 
 
 
425 aa  67  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  22.25 
 
 
444 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  23.61 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  24.56 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  22.96 
 
 
441 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  21.97 
 
 
480 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  24.69 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.69 
 
 
437 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  23.96 
 
 
483 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  27.71 
 
 
457 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  24.24 
 
 
447 aa  64.7  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  23.48 
 
 
447 aa  63.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  29.19 
 
 
515 aa  63.5  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  20.32 
 
 
477 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  33.61 
 
 
458 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  30.47 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2609  Na+/H+ antiporter NhaC  24.78 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  24.31 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  23.7 
 
 
470 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  23.7 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  26.47 
 
 
467 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  24.26 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  23.56 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  21.68 
 
 
481 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 
525 aa  61.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3617  Na+/H+ antiporter NhaC  22.11 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1670  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 
483 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1733  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 
483 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1609  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 
483 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1787  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 
483 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1668  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 
483 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  21.52 
 
 
478 aa  60.1  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  23.18 
 
 
443 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  42.71 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  24.41 
 
 
467 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  23.94 
 
 
467 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  24.33 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  24.33 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.33 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  24.33 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  24.33 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  24.33 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  23.94 
 
 
467 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  30.67 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  23.86 
 
 
470 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  23.53 
 
 
510 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  27.31 
 
 
574 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  40.62 
 
 
493 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  26.84 
 
 
482 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  24.22 
 
 
541 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  25.99 
 
 
569 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  25.29 
 
 
467 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  38.83 
 
 
528 aa  58.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  36.96 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>