More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0685 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0685  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  31.25 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.06 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  32.25 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.42 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  29 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  30.66 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  30.29 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  31.39 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 291 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  30.87 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.04 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.88 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.7 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  27.82 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.28 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  27.72 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.37 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.52 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.91 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  28.38 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.11 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>