More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0737 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  39.11 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  37.74 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.85 
 
 		 529 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.16 
 
 		 528 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 514 aa  145  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  38.25 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  35.48 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  37.96 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  38.71 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  36.94 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  36.99 
 
 		 268 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  38.22 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  38.16 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  37.17 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  38.21 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  38.21 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  38.21 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  38.22 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  38.22 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  36.97 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.91 
 
 		 510 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  36.87 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  34.25 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  37.78 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  36.2 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  36.77 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  35.45 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  36.74 
 
 		 226 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  37.91 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  37.62 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  35 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  33.8 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  33.94 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.2 
 
 		 516 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  33.63 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  35.27 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.75 
 
 		 516 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  33.94 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  38.25 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.84 
 
 		 534 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  35.29 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  34.25 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  35.45 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.96 
 
 		 511 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  34.56 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  37.74 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>