More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0679 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0679  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 328 aa  670    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  40.65 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  36.28 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  37.04 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  36.78 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  36.92 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  38.39 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2291  KpsF/GutQ family protein  39.65 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.827671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  38.91 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  38.38 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  35.98 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  38.25 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  36.62 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  37.46 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  35.2 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  35.17 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  36.77 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  35.62 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  35.67 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0183  KpsF/GutQ family protein  36.22 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.0516701 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  36.9 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  36.05 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  36.24 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  35.17 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  38.62 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  37.02 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  37.19 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  38.19 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  36.05 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  35.2 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  35.13 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  37.12 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  34.5 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  37.5 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  36.27 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  35.92 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  35.71 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  37.41 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1281  KpsF/GutQ family protein  35.62 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  37.41 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  35.83 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  36.9 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  36.86 
 
 		 340 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  36.94 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  37.46 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0211  KpsF/GutQ  34.67 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  37.7 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.3 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.3 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.3 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  35.37 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  36.52 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.82 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  36.9 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  34.46 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  37.68 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  37.88 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  34.77 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  35.03 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  34.05 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  33.54 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  34.69 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  39.08 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  37.81 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.49 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  34.95 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  37.5 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.49 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  34.95 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.49 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.49 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  33.86 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  36.9 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  36.9 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  34.09 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  36.62 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  35.84 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  35.07 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  36.86 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  35.62 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  36.01 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  34.74 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  35.31 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  34.67 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  36.62 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  35.62 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  34.62 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  35.05 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  36.12 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  35.86 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  35.56 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  34.29 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>