More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13696 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  100 
 
 
541 aa  1097    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  54.13 
 
 
585 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  47.55 
 
 
547 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  48.14 
 
 
543 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  47.46 
 
 
552 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  42.7 
 
 
546 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  42.88 
 
 
561 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42 
 
 
586 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  40.54 
 
 
546 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 
542 aa  371  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  40.75 
 
 
560 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  51.87 
 
 
537 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  38.74 
 
 
541 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  36.66 
 
 
534 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  37.01 
 
 
533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  37.17 
 
 
522 aa  299  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  38.1 
 
 
552 aa  297  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  34.67 
 
 
554 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.47 
 
 
543 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  34.6 
 
 
543 aa  261  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 
543 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  34.8 
 
 
543 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  34.2 
 
 
541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.4 
 
 
537 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 
543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  34.59 
 
 
536 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  31.6 
 
 
527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 
528 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
533 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.38 
 
 
536 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.38 
 
 
536 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.39 
 
 
543 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.38 
 
 
536 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.19 
 
 
536 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.19 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.19 
 
 
536 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 
536 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 
594 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.67 
 
 
529 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  25.16 
 
 
558 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  23.57 
 
 
530 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  24.05 
 
 
554 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  24.71 
 
 
555 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  26.4 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
535 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  25.94 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  25.94 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  25.94 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  25.94 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  25.94 
 
 
537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  25.94 
 
 
537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  25.62 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.11 
 
 
529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  25.73 
 
 
537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 
535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
558 aa  117  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 
544 aa  117  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  24.45 
 
 
544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 
541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  26.27 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  26.45 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  26.45 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  26.27 
 
 
537 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.36 
 
 
545 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
529 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  24.91 
 
 
538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.72 
 
 
537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  26.27 
 
 
537 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 
543 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  24.84 
 
 
538 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
501 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
549 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
534 aa  110  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.48 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 
590 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  25.29 
 
 
543 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 
543 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
549 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 
543 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 
543 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  25.29 
 
 
543 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
558 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>