118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12530 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  100 
 
 		 445 aa  863    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  65.12 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  65.25 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  65.25 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  65.25 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  64.41 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 445 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 467 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  41.81 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  36.36 
 
 		 449 aa  230  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 429 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  31.68 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.5 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28.54 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  27.58 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 467 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.91 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 465 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  28.91 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  25.61 
 
 		 458 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 493 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 416 aa  120  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  24.6 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  25.17 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  29.17 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 466 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.11 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 447 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  23.32 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  23.08 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  22.33 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  22.33 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  22.33 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  22.33 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  22.57 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  22.33 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  26.65 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  22.09 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  26.35 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 433 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  25.92 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  25.64 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  24.71 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  25.58 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 439 aa  86.7  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.04 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.49 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  26.42 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  26.68 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  24.84 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  22.48 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  22.05 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>