45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11865 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  100 
 
 
677 aa  1346    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  55.31 
 
 
685 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  55.31 
 
 
685 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  55.36 
 
 
688 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  60.21 
 
 
636 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  54.8 
 
 
640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  30.58 
 
 
596 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  32.39 
 
 
394 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  34.18 
 
 
368 aa  105  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  27.26 
 
 
584 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 
599 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  25.13 
 
 
587 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  24.41 
 
 
560 aa  90.9  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  24.35 
 
 
607 aa  88.2  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 
814 aa  82.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 
608 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  23.23 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  23.12 
 
 
609 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  24.11 
 
 
596 aa  77.4  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  24.82 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  25.08 
 
 
618 aa  74.7  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 
547 aa  71.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
587 aa  67.8  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 
615 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  21.73 
 
 
601 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 
586 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  32.31 
 
 
224 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  25.05 
 
 
583 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  23.86 
 
 
655 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  24.02 
 
 
564 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  21.92 
 
 
609 aa  64.3  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  22.93 
 
 
594 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  23.87 
 
 
562 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
527 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 
576 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.77 
 
 
562 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  24.43 
 
 
594 aa  55.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 
583 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 
583 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
593 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  22.44 
 
 
561 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  28.3 
 
 
355 aa  51.6  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  21.6 
 
 
588 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  22.49 
 
 
647 aa  48.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  34.21 
 
 
283 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>