70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10651 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 161 aa  319  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  50.93 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  51.5 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 147 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 147 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  48.12 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  46.59 
 
 		 136 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  41.13 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  44.71 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  52.63 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  49.41 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  37.27 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  47.3 
 
 		 85 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  45.83 
 
 		 84 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  53.57 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  44.44 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  40.77 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  44.64 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  38.75 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.14 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  49.09 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  36.92 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  36.71 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  33.75 
 
 		 75 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  48.15 
 
 		 82 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  48.15 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  37.97 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  37.84 
 
 		 75 aa  51.2  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  33.68 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  41.33 
 
 		 93 aa  50.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  39.44 
 
 		 98 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  36.99 
 
 		 92 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  39.47 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.15 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  26.79 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 83 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 60 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 60 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 83 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 89 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  39.02 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  37.33 
 
 		 103 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 72 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 59 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 79 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 123 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>