64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2176 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  767    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.491905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2018  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0566522 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1989  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00570868  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2181  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  20.83 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  21.47 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6164  D-amino-acid dehydrogenase  24.44 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1915  D-amino-acid dehydrogenase  24.44 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.05 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  23.79 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  22.73 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  22.33 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  34.91 
 
 		 422 aa  46.2  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1938  D-amino-acid dehydrogenase  24.22 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5216  D-amino-acid dehydrogenase  23.33 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1903  D-amino-acid dehydrogenase  24.44 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.612686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1833  D-amino-acid dehydrogenase  24.44 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  48.78 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  22.6 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  26.07 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  27.85 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.32 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  26.44 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 442 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.83 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1359  D-amino-acid dehydrogenase  45.65 
 
 		 434 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385904  normal  0.690046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.24 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  20.94 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.6 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.6 
 
 		 434 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.6 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 500 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>