172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1117 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  100 
 
 		 505 aa  1057    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  67.87 
 
 		 498 aa  717    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  49.49 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  50.4 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  49.7 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  49.29 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  50 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  48.48 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.41 
 
 		 492 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.06 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.56 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.05 
 
 		 537 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.54 
 
 		 532 aa  353  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.09 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.37 
 
 		 476 aa  306  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.18 
 
 		 508 aa  276  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.41 
 
 		 508 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.58 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  31.5 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  33.66 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  33.54 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  34.72 
 
 		 512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.3 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.12 
 
 		 525 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  33.55 
 
 		 512 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.12 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  33.75 
 
 		 514 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.86 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.67 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.24 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  32.46 
 
 		 524 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.24 
 
 		 528 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.25 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.28 
 
 		 508 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.64 
 
 		 512 aa  239  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.89 
 
 		 525 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  31.16 
 
 		 508 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.11 
 
 		 502 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  31.74 
 
 		 521 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.31 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.11 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.47 
 
 		 508 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  34.61 
 
 		 516 aa  236  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.31 
 
 		 521 aa  236  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.42 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.11 
 
 		 521 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.8 
 
 		 508 aa  233  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.11 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.89 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.95 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.33 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.57 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.82 
 
 		 525 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.38 
 
 		 525 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  32.35 
 
 		 514 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.22 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.87 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.39 
 
 		 498 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.6 
 
 		 525 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.16 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  32.23 
 
 		 521 aa  223  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  35.04 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.21 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.07 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.76 
 
 		 510 aa  219  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.45 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.03 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.09 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.11 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  30.96 
 
 		 523 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  31.08 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.55 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  30.32 
 
 		 508 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  31.06 
 
 		 569 aa  202  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.79 
 
 		 531 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.53 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.4 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.18 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.86 
 
 		 510 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.33 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.33 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.33 
 
 		 496 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.87 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  30.67 
 
 		 508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.06 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.82 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  34.75 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.51 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.41 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.94 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.9 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.89 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.78 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  21.45 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.27 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.21 
 
 		 481 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.68 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  27.7 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  27.7 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>