More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0161 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_1215  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  73.25 
 
 		 473 aa  742    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17171  isocitrate dehydrogenase  77.43 
 
 		 474 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.271508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3969  isocitrate dehydrogenase  73.94 
 
 		 475 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18051  isocitrate dehydrogenase  75.32 
 
 		 474 aa  773    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1170  isocitrate dehydrogenase  78.69 
 
 		 474 aa  797    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17831  isocitrate dehydrogenase  74.26 
 
 		 474 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20451  isocitrate dehydrogenase  78.69 
 
 		 474 aa  798    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4831  isocitrate dehydrogenase  74.52 
 
 		 473 aa  749    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0191  isocitrate dehydrogenase  92.41 
 
 		 474 aa  910    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0161  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  978    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0700483 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1688  isocitrate dehydrogenase  75.53 
 
 		 474 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1719  isocitrate dehydrogenase  77.75 
 
 		 475 aa  765    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4014  isocitrate dehydrogenase  74.15 
 
 		 475 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25761  isocitrate dehydrogenase  90.08 
 
 		 474 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17881  isocitrate dehydrogenase  75.53 
 
 		 474 aa  772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2071  isocitrate dehydrogenase  71.4 
 
 		 475 aa  725    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00869667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0071  isocitrate dehydrogenase  70.49 
 
 		 472 aa  715    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0313  isocitrate dehydrogenase  70.76 
 
 		 475 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  56.48 
 
 		 481 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.62 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1038  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.14 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000173439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  53.38 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.86 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  51.38 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  50.43 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  50.64 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  50.64 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  50.53 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  50.43 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  50.53 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  50.64 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  50.64 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  50.43 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  50.43 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  52.79 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.21 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  50.32 
 
 		 416 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  50.11 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  52.26 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.89 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.87 
 
 		 414 aa  445  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  50.32 
 
 		 416 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  50.32 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.42 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.57 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  50 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  51.61 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  52.01 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  49.37 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  50.11 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.87 
 
 		 417 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  50.11 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  49.37 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  49.68 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  49.46 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  49.89 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  49.68 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  51.12 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  49.68 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  49.47 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  49.89 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  49.15 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2769  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.47 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  51.22 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  50.88 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.17 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.34 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  50.33 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  47.6 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.83 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  49.56 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  50.11 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.56 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  50.11 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  49.56 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  52.92 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.89 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.52 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5856  isocitrate dehydrogenase  49.67 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261017  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  52.92 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2761  isocitrate dehydrogenase  48.62 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0660078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.52 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2443  isocitrate dehydrogenase  47.98 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000919661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  51.84 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  52.7 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2572  isocitrate dehydrogenase  47.98 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  48.13 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2524  isocitrate dehydrogenase  49.67 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>