127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1306 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  100 
 
 		 507 aa  1053    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  77.14 
 
 		 515 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  71.97 
 
 		 511 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  71.77 
 
 		 510 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  69.05 
 
 		 507 aa  738    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  53.12 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  53.27 
 
 		 508 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  54.7 
 
 		 508 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  51.91 
 
 		 508 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  52.31 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  55.65 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  46.03 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  42.46 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  42.66 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  42.66 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  38.98 
 
 		 524 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  42.22 
 
 		 526 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  41.3 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  42.33 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  40.89 
 
 		 524 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  40.26 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  38.22 
 
 		 517 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  38.76 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  42.03 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  41.08 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  40.25 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  39.96 
 
 		 522 aa  362  8e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  38.72 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  36.94 
 
 		 528 aa  359  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  37.01 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  39.65 
 
 		 527 aa  356  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  38.26 
 
 		 505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  38.51 
 
 		 517 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  36.38 
 
 		 543 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  38.76 
 
 		 513 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  40.17 
 
 		 518 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  36.19 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  35.88 
 
 		 543 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  35.88 
 
 		 543 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  36.57 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  39.23 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  35.47 
 
 		 531 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.12 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 529 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 529 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  35.84 
 
 		 501 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.19 
 
 		 501 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  36.19 
 
 		 498 aa  257  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.48 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.27 
 
 		 538 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  37.47 
 
 		 506 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.42 
 
 		 538 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.42 
 
 		 538 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.77 
 
 		 538 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.2 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 507 aa  247  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  34.65 
 
 		 501 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  35.29 
 
 		 517 aa  239  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.15 
 
 		 502 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.2 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  31.97 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  32.74 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  32.16 
 
 		 499 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  33.46 
 
 		 497 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 499 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.77 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  31.78 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  34.64 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.49 
 
 		 502 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  33.88 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 504 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  31.12 
 
 		 505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  32.76 
 
 		 506 aa  226  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 505 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  31.09 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.49 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  33.41 
 
 		 510 aa  225  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  32.21 
 
 		 740 aa  223  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 507 aa  223  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  31.73 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  30.86 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  33.04 
 
 		 504 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.09 
 
 		 496 aa  220  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 523 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  31.29 
 
 		 501 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  32.49 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  32.5 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.59 
 
 		 492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 496 aa  217  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  35.29 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>