92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4541 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 441 aa  878    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  61.7 
 
 		 449 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  61.09 
 
 		 449 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  60.86 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  59.68 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  54.3 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  53.3 
 
 		 437 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  52.87 
 
 		 437 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  58.62 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  51.74 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  37.47 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  36.03 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  34.95 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  34.95 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  34.01 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  34.23 
 
 		 439 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  33.03 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  32.51 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  33.78 
 
 		 446 aa  177  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  33.64 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  32.02 
 
 		 445 aa  160  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  33.11 
 
 		 454 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  31.39 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  28.15 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  30.04 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  30.34 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  33.48 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  31.17 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  32.54 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  33.63 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  31.67 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  32.8 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  34 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  30.3 
 
 		 446 aa  132  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  30.04 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  27.25 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  28.81 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  35.04 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  35.34 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  28.64 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  33.56 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  27.42 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  30.51 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  34.33 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  35.07 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  33.09 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  34.65 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  28.87 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  31.21 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  35.05 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  33.1 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  27.97 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  27.97 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  27.73 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  29.06 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  31.36 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  27.17 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  26.89 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  33.91 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  28.81 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  31.36 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  26.89 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  26.89 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  32.12 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  32.89 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  28.02 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  29.17 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  27.66 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  27.86 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  32.14 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  28.37 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>