79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4000 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  778    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  46.11 
 
 		 423 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  41.05 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  34.69 
 
 		 591 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  40.68 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  39.66 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  42.73 
 
 		 452 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  42.73 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 673 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  33.88 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  35.59 
 
 		 678 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 746 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.8 
 
 		 1182 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  36.22 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  30.57 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 1185 aa  93.2  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.34 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 1239 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  31.72 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  28.8 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  28.5 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  55.56 
 
 		 1152 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  55.56 
 
 		 1152 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  29.74 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  52.94 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  53.45 
 
 		 1044 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  44.26 
 
 		 1067 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  48.15 
 
 		 1366 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  28.21 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  52.08 
 
 		 849 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  50.91 
 
 		 1476 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  51.85 
 
 		 1247 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  57.78 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 1302 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  57.89 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  29.27 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 		 665 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  52.83 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  52.94 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  27.13 
 
 		 769 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  54.35 
 
 		 120 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  52.94 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  40.58 
 
 		 1236 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  52.83 
 
 		 1035 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 1317 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  50.85 
 
 		 597 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 		 857 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  48.28 
 
 		 294 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  52.17 
 
 		 115 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  50.91 
 
 		 995 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  39.22 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  24.75 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  47.73 
 
 		 987 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  47.92 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  45.16 
 
 		 1313 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  45.16 
 
 		 1322 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  37.31 
 
 		 255 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  52.08 
 
 		 995 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 		 756 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 		 680 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 		 1264 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  43.86 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  46.67 
 
 		 1632 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  46.67 
 
 		 1806 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  27.15 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 1301 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  23.41 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  41.18 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  41.51 
 
 		 916 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  39.71 
 
 		 751 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  39.71 
 
 		 751 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  38.98 
 
 		 235 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 872 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  41.82 
 
 		 2342 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  41.82 
 
 		 2342 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  43.18 
 
 		 736 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1185  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>