28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0903 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  39.88 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  41.53 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  40.38 
 
 		 362 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  28.24 
 
 		 423 aa  93.2  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  27.15 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  27.66 
 
 		 678 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  28.88 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  31.53 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  30.49 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  30.49 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  28.5 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 673 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  24.05 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  27.08 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  26.74 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  27.97 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  22.7 
 
 		 1182 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 1185 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  22.38 
 
 		 1239 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  29.91 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  28.89 
 
 		 769 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 1991 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.63 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  27.54 
 
 		 430 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  23.64 
 
 		 276 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>