40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3920 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  99.12 
 
 		 452 aa  873    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  879    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  49.47 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  46.79 
 
 		 488 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  47.03 
 
 		 678 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  43.35 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  40.89 
 
 		 591 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  35.42 
 
 		 746 aa  170  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  48.44 
 
 		 278 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  34.75 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  29.7 
 
 		 1182 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  44.3 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  38.39 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 1239 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  38.58 
 
 		 294 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.81 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 673 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  32.54 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  31.46 
 
 		 358 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 1185 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  29.81 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  29.18 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  30.49 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  33.82 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  28.36 
 
 		 222 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  28.65 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  35.42 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  31.72 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  27.98 
 
 		 1209 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  27.52 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  26.92 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  34.19 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  25.3 
 
 		 769 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  31.69 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  22.01 
 
 		 1991 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  68.75 
 
 		 723 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25.42 
 
 		 1119 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  27.7 
 
 		 274 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.73 
 
 		 957 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>