26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0175 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  557  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  48.12 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  29.22 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  32 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  28.48 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 673 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 1991 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  31.76 
 
 		 425 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  20.74 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  24.61 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  27.27 
 
 		 1209 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  26.97 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  23.95 
 
 		 591 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 746 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  25.95 
 
 		 488 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  20.49 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  24.16 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  26.74 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 		 1239 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0233  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.98 
 
 		 186 aa  45.4  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  3.9384e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.87 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  27.78 
 
 		 469 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  21.46 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  25.68 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 1185 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.22 
 
 		 964 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.205054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>