36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2476 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  39.68 
 
 
423 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  38.58 
 
 
452 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  36.22 
 
 
399 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  36.07 
 
 
488 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  38.07 
 
 
452 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  33.87 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  31.96 
 
 
591 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  33.88 
 
 
469 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  33.85 
 
 
678 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  30.28 
 
 
430 aa  92.4  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  28.29 
 
 
339 aa  89.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  26.96 
 
 
471 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
673 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  29.35 
 
 
746 aa  79.7  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.7 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  29.58 
 
 
769 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  29.3 
 
 
1182 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  26.77 
 
 
478 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
1239 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  32.67 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  25.25 
 
 
222 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  24.75 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
1185 aa  58.9  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
1991 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  26.01 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  29.41 
 
 
358 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  27.15 
 
 
1209 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  28.21 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  32 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  28.17 
 
 
362 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  28.57 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  27.03 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  28.41 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  27.27 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0502651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>