31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4120 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  34.56 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  29.12 
 
 		 478 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  29.44 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 1991 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  33.09 
 
 		 1209 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  33.79 
 
 		 1182 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 1239 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  30.92 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.56 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  29.93 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  32.64 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  29.37 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  34.29 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  28.78 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  28.83 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  26.57 
 
 		 488 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  29.29 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  24.75 
 
 		 399 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  27.27 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  27.08 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 746 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  28.19 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  29.91 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  24.69 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4074  hypothetical protein  37.25 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.488227  normal  0.187336 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6258  hypothetical protein  37.25 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  26.47 
 
 		 769 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  27.27 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  25.64 
 
 		 678 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>