36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4285 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  35.66 
 
 
423 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  48.44 
 
 
452 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  48.44 
 
 
452 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  37.01 
 
 
591 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  38.03 
 
 
469 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  39.66 
 
 
399 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  35.71 
 
 
488 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  31.48 
 
 
678 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  32.02 
 
 
339 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.16 
 
 
1182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  36.12 
 
 
430 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  31.28 
 
 
746 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
1239 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.7 
 
 
418 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
673 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  33.87 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  27.15 
 
 
326 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
1185 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  28.85 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  35.36 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  27.36 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  26.87 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  29.06 
 
 
425 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  27.51 
 
 
471 aa  65.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  24.07 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  24.07 
 
 
222 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  32.72 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  28.32 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  23.68 
 
 
769 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  29.93 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  26.14 
 
 
478 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  26.76 
 
 
1209 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  28.19 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
1991 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  25.68 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>