22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0457 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  728    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  53.49 
 
 
362 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  39.83 
 
 
358 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  40.38 
 
 
326 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  32.64 
 
 
488 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  26.4 
 
 
423 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  33.02 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  30.9 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  34.16 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  33.5 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  26.52 
 
 
678 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  27.36 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  29.74 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  29.3 
 
 
591 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  24.03 
 
 
222 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  26.16 
 
 
222 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  27.67 
 
 
430 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
673 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  28.17 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  25.32 
 
 
1209 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
1185 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  31.2 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>