32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01351 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  100 
 
 
769 aa  1553    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  31.98 
 
 
1182 aa  85.1  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  26.92 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  29.58 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  31.18 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  28.87 
 
 
488 aa  64.3  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  34.31 
 
 
358 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 
746 aa  63.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  28.74 
 
 
591 aa  61.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
1067 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  26.19 
 
 
469 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  32.06 
 
 
597 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  28.99 
 
 
268 aa  55.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  25.79 
 
 
339 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  27.13 
 
 
399 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  25.3 
 
 
452 aa  54.7  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  25.3 
 
 
452 aa  54.3  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.95 
 
 
1366 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
1239 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
1991 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
673 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  24.32 
 
 
362 aa  52  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  25.17 
 
 
430 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  23.81 
 
 
222 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.17 
 
 
418 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  23.78 
 
 
678 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  23.68 
 
 
278 aa  48.9  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01331  hypothetical protein  26.29 
 
 
972 aa  48.9  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  22.56 
 
 
222 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  27.41 
 
 
849 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  28.89 
 
 
326 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  22.84 
 
 
478 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>