37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3314 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  868    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  36.34 
 
 		 488 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  43.35 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  43.35 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  42.36 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  33 
 
 		 678 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  46.11 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  37.72 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  35.66 
 
 		 278 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 746 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  40.4 
 
 		 591 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  30.67 
 
 		 1182 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  39.68 
 
 		 294 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 673 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  33.2 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.53 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  29.61 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 1239 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 1185 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  26.4 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  31.08 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  28.24 
 
 		 326 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  27.56 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  26.83 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  33.97 
 
 		 289 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  31.91 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  31.18 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  31.33 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  24.51 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  29.17 
 
 		 1209 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  28.17 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  24.14 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 1991 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  28.28 
 
 		 276 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  26.24 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  27.08 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  24.61 
 
 		 269 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>