More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3965 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 330 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  57.14 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  52.06 
 
 		 320 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  50.96 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  50.94 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  51.13 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  47.81 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  48.45 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  45.08 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  47.59 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  48.16 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  43.71 
 
 		 315 aa  278  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  44.38 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  43.17 
 
 		 336 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  48.89 
 
 		 338 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  45.11 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  45.17 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  43.49 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  44.75 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  44.88 
 
 		 341 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  49.35 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  43.81 
 
 		 337 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  45 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  44.27 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  40.26 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  44.34 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  47.44 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  43.52 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  44.06 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  43.52 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  44.52 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  43.21 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  45.28 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  43.52 
 
 		 324 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  44.55 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  42.63 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  45.03 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  43.26 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  44.97 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  44.65 
 
 		 340 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  44.1 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  47.44 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  42.59 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  42.59 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  42.72 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  46.23 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  44.24 
 
 		 326 aa  255  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  42.01 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  43.53 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  42.55 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  42.68 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  42.49 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  42.32 
 
 		 326 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  46.1 
 
 		 340 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  41.61 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  41.9 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  39.05 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  39.05 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  45.48 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.22 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  43.21 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  42.54 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  45.02 
 
 		 338 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  39.56 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  43.52 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  41.77 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  42.12 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.27 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  39.05 
 
 		 324 aa  241  9e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  42.63 
 
 		 326 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  45 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  42.63 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.69 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.69 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.77 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.69 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.14 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  41.38 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  40.32 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.82 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  43.65 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  40.25 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  43.65 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  43.79 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  37.65 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  42.95 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  44.19 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>