More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3287 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1418  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.17 
 
 
257 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.74 
 
 
257 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.479548 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3633  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
265 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187404  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.55 
 
 
249 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
248 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
251 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
260 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 
250 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
246 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.61 
 
 
250 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 
250 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
249 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
258 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
249 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
262 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
251 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4155  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.84 
 
 
243 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0471031  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
255 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
249 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  30.33 
 
 
243 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
253 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
260 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
248 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  33.47 
 
 
247 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
266 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
246 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2760  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.97 
 
 
241 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2737  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
249 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
262 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
244 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
247 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
262 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  28.86 
 
 
247 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
233 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
282 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
262 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 
246 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
280 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.48 
 
 
255 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 
246 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
249 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  35.2 
 
 
250 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1327  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.82 
 
 
243 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
255 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
247 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  28.46 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
247 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0830  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.26 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.3 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.06 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
250 aa  99  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
263 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
263 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
263 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
263 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
263 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.86 
 
 
249 aa  98.6  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
268 aa  98.2  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
258 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0078052  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  29.67 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  32.13 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5109  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.71 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  29.03 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.55 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>