More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0669 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0669  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 560 aa  1131    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  55.47 
 
 		 555 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  54.79 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  53.72 
 
 		 563 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  51.28 
 
 		 559 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  53.08 
 
 		 564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  53.08 
 
 		 564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  51.81 
 
 		 563 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  51.79 
 
 		 566 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  53.39 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  53.39 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  53.39 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  52.58 
 
 		 568 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  51.89 
 
 		 574 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  54.46 
 
 		 560 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  51.97 
 
 		 565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  51.97 
 
 		 565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  53.21 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  51.77 
 
 		 568 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  51.77 
 
 		 568 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  51.77 
 
 		 568 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  51.79 
 
 		 609 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  52.46 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  52.72 
 
 		 562 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  51.96 
 
 		 568 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  53.55 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  51.79 
 
 		 568 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  51.45 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  52.99 
 
 		 563 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  51.48 
 
 		 573 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  50.8 
 
 		 568 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  51.42 
 
 		 576 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  51.72 
 
 		 568 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  50.44 
 
 		 568 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  51.26 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  51.05 
 
 		 572 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  50.52 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  53.96 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  50.98 
 
 		 576 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  51.26 
 
 		 569 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2555  AMP-dependent synthetase and ligase  51.16 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  52.36 
 
 		 577 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  51.29 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  51.25 
 
 		 562 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  52.18 
 
 		 556 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2842  AMP-dependent synthetase and ligase  50.98 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0429  AMP-dependent synthetase and ligase  50.91 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  50.63 
 
 		 566 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 		 580 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22620  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  49.73 
 
 		 594 aa  512  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  50.89 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 		 565 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 		 565 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  49.64 
 
 		 565 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  49.37 
 
 		 581 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  47.2 
 
 		 593 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4866  AMP-dependent synthetase and ligase  48.41 
 
 		 565 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122937  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2378  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 567 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900828  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  47.65 
 
 		 587 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 571 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 551 aa  340  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 567 aa  336  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  35.9 
 
 		 559 aa  333  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 609 aa  333  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 627 aa  333  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 555 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 564 aa  330  5.0000000000000004e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 616 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  35.27 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 554 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 552 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  38.14 
 
 		 563 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 559 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  36.93 
 
 		 550 aa  316  7e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 559 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 534 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 593 aa  306  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  37.38 
 
 		 549 aa  306  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 552 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 546 aa  300  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  36.02 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  33.51 
 
 		 589 aa  294  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  32.86 
 
 		 594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  33.71 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  33.59 
 
 		 550 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 528 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  33.88 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.88 
 
 		 528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.67 
 
 		 528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  33.61 
 
 		 528 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>