More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0625 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  65 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  67.68 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  56.44 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  60.44 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  51 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 98 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  39.62 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.24 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  35.71 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  40.95 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  27.84 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.41 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  41.56 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  41.56 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  39 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  34.52 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  27.55 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.79 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  28 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  28.87 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>