More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.18 
 
 
487 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
484 aa  974    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.94 
 
 
489 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  65.15 
 
 
485 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  65.07 
 
 
491 aa  583  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.62 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.33 
 
 
493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.04 
 
 
489 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  61.8 
 
 
487 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  58.84 
 
 
490 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  59.83 
 
 
487 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.16 
 
 
497 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.37 
 
 
482 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  58.63 
 
 
496 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
485 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.16 
 
 
482 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  62.53 
 
 
476 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  60.57 
 
 
487 aa  543  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  60.08 
 
 
502 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  61.12 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
488 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  59.62 
 
 
489 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
514 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.08 
 
 
482 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.71 
 
 
485 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  56.62 
 
 
487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
493 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.05 
 
 
490 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  55.93 
 
 
489 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.7 
 
 
486 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.21 
 
 
500 aa  498  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 
495 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.95 
 
 
482 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.16 
 
 
482 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.74 
 
 
482 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.38 
 
 
495 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.74 
 
 
482 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  50.74 
 
 
482 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.74 
 
 
482 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.74 
 
 
482 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  52.32 
 
 
482 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
483 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.27 
 
 
492 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.53 
 
 
482 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.74 
 
 
477 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  52 
 
 
481 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.95 
 
 
482 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.95 
 
 
482 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.95 
 
 
482 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52 
 
 
480 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.95 
 
 
482 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.64 
 
 
500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.95 
 
 
483 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.22 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.21 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.22 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.53 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
480 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.53 
 
 
480 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
484 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.59 
 
 
483 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.53 
 
 
483 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.25 
 
 
502 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  53.68 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
496 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
486 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.22 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.89 
 
 
480 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
493 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.89 
 
 
480 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
500 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
486 aa  458  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
484 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
500 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.89 
 
 
480 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.68 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
492 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
486 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
503 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
488 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
485 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
485 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2534  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.63 
 
 
486 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.5 
 
 
493 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.09 
 
 
486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.47 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
489 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
489 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>