48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  839    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  33.75 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  33.24 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  32.01 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  32.36 
 
 		 443 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  32.36 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  32.04 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  32.48 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  32.29 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  32.85 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  29.88 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  33.56 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  28.16 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  42.68 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  43.04 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.24 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  40.51 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  39.24 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  29.84 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  23.14 
 
 		 356 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  36.14 
 
 		 508 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  29.2 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  31.78 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.57 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  28.46 
 
 		 468 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  34.41 
 
 		 315 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  29.35 
 
 		 274 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.12 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  32.69 
 
 		 300 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  29.91 
 
 		 293 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  31.78 
 
 		 357 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  35.23 
 
 		 283 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  37.8 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3910  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5439  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.92 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5484  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.92 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5568  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5518  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  28.92 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5639  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.92 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5087  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase)  28.92 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000098556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase)  28.92 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.248446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5240  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.92 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  30.84 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5512  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.71 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  33.75 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  35.71 
 
 		 271 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>