243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  100 
 
 
346 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  45.31 
 
 
357 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  44.94 
 
 
334 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  42.59 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  43.83 
 
 
348 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  42.27 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  45.28 
 
 
348 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  42.19 
 
 
330 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.92 
 
 
371 aa  212  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  39.4 
 
 
424 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  39 
 
 
337 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  39.43 
 
 
435 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  39.4 
 
 
374 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  39.18 
 
 
335 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  40.43 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  41.96 
 
 
334 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  36.31 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  37.31 
 
 
404 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  37.75 
 
 
373 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  36.53 
 
 
345 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.68 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  38.62 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  37.69 
 
 
364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  36.54 
 
 
350 aa  149  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  32.4 
 
 
378 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  33.33 
 
 
397 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 
373 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.07 
 
 
643 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.75 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35 
 
 
622 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.53 
 
 
622 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  32.05 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  31.06 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  33.72 
 
 
541 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.11 
 
 
568 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 
1065 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.06 
 
 
634 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  30.12 
 
 
1105 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.06 
 
 
631 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  32.84 
 
 
558 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.27 
 
 
647 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
540 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.22 
 
 
568 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11346  adenylate cyclase  33.9 
 
 
217 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.306360000000001e-28  normal  0.760848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
540 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
540 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
597 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 
275 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.68 
 
 
596 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.29 
 
 
1291 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  27.37 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  26.38 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
626 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.88 
 
 
513 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.71 
 
 
723 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
1142 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  35.76 
 
 
1122 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4600  putative adenylate/guanylate cyclase  47.06 
 
 
113 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
449 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
449 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
449 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
642 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  34.31 
 
 
1094 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  35.81 
 
 
536 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
536 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.68 
 
 
758 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  33.08 
 
 
603 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 
275 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  31.88 
 
 
581 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.17 
 
 
738 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 
1046 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  26.71 
 
 
294 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
667 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  30.32 
 
 
652 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 
1123 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.2 
 
 
624 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
1093 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  25.6 
 
 
684 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  29.65 
 
 
670 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 
536 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  32.26 
 
 
1377 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>