274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  51.02 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  45.83 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  43.15 
 
 		 200 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  44.38 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  48.65 
 
 		 153 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  39.6 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  38.99 
 
 		 193 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  42.47 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  41.61 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  41.89 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  41.89 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  38 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  40.52 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  40.91 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  41.22 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  39.6 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  37.5 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  43.71 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  42.38 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  40 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  43.54 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  41.61 
 
 		 153 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  43.42 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  38.06 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  40.14 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  40.41 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  35.48 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  38.06 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  37.66 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  40.52 
 
 		 617 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  36.36 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  33.99 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  40.4 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  38.36 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  37.58 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  39.07 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  37.75 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  37.66 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  37.75 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  38.96 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  37.75 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  38.99 
 
 		 201 aa  101  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  41.33 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  37.89 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  36.31 
 
 		 157 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  39.16 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  38.67 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  40.3 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  36.77 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  35.03 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  41.79 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  35.06 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  34.57 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  36.65 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  37.18 
 
 		 155 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  33.77 
 
 		 149 aa  91.7  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  36.94 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  36.11 
 
 		 155 aa  90.9  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  39.1 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  39.1 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  42.95 
 
 		 149 aa  90.1  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  34.69 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  33.33 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  39.55 
 
 		 247 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  37.72 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  35.43 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  40.79 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  40.25 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  37.66 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  33.74 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  37.18 
 
 		 158 aa  84.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  33.11 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  33.33 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  35.44 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  37.5 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  33.33 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  44.09 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  31.65 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  31.65 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  40.91 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  37.21 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  37.8 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  33.92 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  40.31 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  40.31 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  36.43 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  40.31 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  40.31 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  40.31 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  40.31 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  31.36 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  33.33 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  33.33 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  33.33 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>