More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1486 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
460 aa  954    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.75 
 
 
449 aa  659    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.52 
 
 
450 aa  696    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.91 
 
 
460 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.91 
 
 
460 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.82 
 
 
457 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.68 
 
 
453 aa  627  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.43 
 
 
459 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.36 
 
 
457 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.59 
 
 
458 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.92 
 
 
484 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.38 
 
 
456 aa  614  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.89 
 
 
466 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.08 
 
 
456 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.08 
 
 
456 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.33 
 
 
456 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.08 
 
 
456 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.71 
 
 
431 aa  608  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.98 
 
 
473 aa  609  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.4 
 
 
459 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.57 
 
 
486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.5 
 
 
459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.47 
 
 
453 aa  595  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.08 
 
 
466 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.08 
 
 
466 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.4 
 
 
489 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.49 
 
 
468 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.06 
 
 
463 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.06 
 
 
463 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.06 
 
 
463 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.14 
 
 
585 aa  551  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.81 
 
 
606 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.94 
 
 
573 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.3 
 
 
567 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 
666 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.98 
 
 
586 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.98 
 
 
586 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.98 
 
 
586 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.62 
 
 
652 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.98 
 
 
586 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.98 
 
 
586 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.98 
 
 
586 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.72 
 
 
586 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.75 
 
 
586 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.33 
 
 
691 aa  532  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.35 
 
 
626 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.75 
 
 
586 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.5 
 
 
573 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.57 
 
 
562 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0162  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.49 
 
 
625 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268503  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.72 
 
 
586 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.75 
 
 
586 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.64 
 
 
561 aa  531  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.98 
 
 
624 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 
530 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.3 
 
 
655 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.55 
 
 
680 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.17 
 
 
530 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.27 
 
 
628 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.58 
 
 
629 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.75 
 
 
630 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.75 
 
 
642 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0500  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.25 
 
 
629 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.76 
 
 
624 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.26 
 
 
630 aa  525  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.95 
 
 
638 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38085  predicted protein  57.86 
 
 
619 aa  525  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.7 
 
 
629 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.68 
 
 
617 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.43 
 
 
631 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.22 
 
 
658 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.86 
 
 
625 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.21 
 
 
635 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.73 
 
 
627 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.95 
 
 
614 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44600  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.72 
 
 
628 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0216  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.42 
 
 
651 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4570  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.42 
 
 
631 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0133622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.21 
 
 
635 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.02 
 
 
626 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.92 
 
 
607 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.42 
 
 
631 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0220  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.42 
 
 
646 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.464551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.74 
 
 
627 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.73 
 
 
627 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.17 
 
 
614 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.8 
 
 
647 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.86 
 
 
631 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4922  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.03 
 
 
626 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.76 
 
 
629 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3201  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.79 
 
 
619 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.814938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.38 
 
 
635 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03824  hypothetical protein  56.86 
 
 
631 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.64 
 
 
630 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.9 
 
 
628 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0609  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.29 
 
 
627 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00366  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.29 
 
 
646 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4228  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.86 
 
 
631 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4031  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.86 
 
 
631 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0125326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.03 
 
 
626 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>