More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0997 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0997  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  60.18 
 
 
228 aa  275  4e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  54.87 
 
 
226 aa  247  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0695  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  53.57 
 
 
223 aa  232  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
225 aa  227  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 
252 aa  221  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 
252 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 
252 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
253 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
252 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
240 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
275 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
275 aa  215  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
253 aa  214  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
253 aa  214  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  49.55 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
253 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
264 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
271 aa  210  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.25 
 
 
266 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
253 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
252 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
252 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
253 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
253 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
252 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  48.68 
 
 
253 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
253 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
252 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
254 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
274 aa  208  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  48.68 
 
 
264 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
259 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0911  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
222 aa  206  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.220596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
275 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0841  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
222 aa  206  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
275 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
275 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
275 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0978  undecaprenyl diphosphate synthetase  44.59 
 
 
222 aa  206  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
263 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
266 aa  205  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
261 aa  205  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
252 aa  204  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
275 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1190  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
222 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0848371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
253 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
253 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.33 
 
 
256 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.46 
 
 
246 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
246 aa  202  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
257 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
256 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.03 
 
 
252 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 
258 aa  201  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.89 
 
 
261 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
268 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
240 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  45.33 
 
 
257 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
249 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.12 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  45.37 
 
 
233 aa  198  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  43.48 
 
 
254 aa  198  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.1 
 
 
258 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
258 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  43.81 
 
 
242 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.81 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.09 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
258 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
258 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
257 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
258 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.95 
 
 
236 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
252 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  43.3 
 
 
258 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
260 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
260 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.36 
 
 
258 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
258 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
260 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.6 
 
 
270 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  45.37 
 
 
251 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
260 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
243 aa  191  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>