More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0362 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0362  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
595 aa  1211    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.77 
 
 
599 aa  525  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0690  penicillin-binding protein  46.22 
 
 
611 aa  511  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.611151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0055  hypothetical protein  45.7 
 
 
610 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  44.92 
 
 
606 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  42.29 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  38.64 
 
 
602 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  40.28 
 
 
585 aa  382  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  39.13 
 
 
579 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  38.31 
 
 
602 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  29.87 
 
 
671 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
662 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  26.69 
 
 
675 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.2 
 
 
675 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.46 
 
 
675 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 
657 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 
582 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 
689 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  29.94 
 
 
660 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 
631 aa  170  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 
670 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 
654 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.14 
 
 
588 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.3 
 
 
645 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 
578 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  26.08 
 
 
577 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 
614 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.11 
 
 
670 aa  161  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  26.94 
 
 
716 aa  160  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  30.56 
 
 
582 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.97 
 
 
703 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  27.97 
 
 
577 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.02 
 
 
657 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.91 
 
 
607 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.66 
 
 
656 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  25.41 
 
 
653 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 
680 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  27.44 
 
 
607 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  26.25 
 
 
580 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  26.52 
 
 
594 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.52 
 
 
594 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  26.91 
 
 
553 aa  154  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.64 
 
 
682 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.56 
 
 
582 aa  153  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  27.56 
 
 
582 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.09 
 
 
609 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  26.45 
 
 
727 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  26.91 
 
 
553 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.48 
 
 
582 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  27.93 
 
 
590 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 
624 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 
670 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  28.5 
 
 
657 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 
615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.62 
 
 
600 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  28.27 
 
 
615 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 
615 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 
615 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 
657 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.34 
 
 
656 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  27.29 
 
 
615 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  26.13 
 
 
600 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 
672 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
649 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1254  peptidoglycan glycosyltransferase  26.52 
 
 
562 aa  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
553 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1265  penicillin-binding protein 1  27.88 
 
 
744 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  25.27 
 
 
582 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 
603 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  27.5 
 
 
615 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1240  penicillin-binding protein 1  27.88 
 
 
744 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.575725  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
574 aa  144  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  26.37 
 
 
616 aa  145  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 
590 aa  145  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  29.81 
 
 
711 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  23.79 
 
 
556 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  25.66 
 
 
839 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 
621 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  26.37 
 
 
673 aa  144  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.01 
 
 
571 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  26.94 
 
 
581 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  26.31 
 
 
638 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  27.66 
 
 
580 aa  144  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  25.52 
 
 
638 aa  144  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  26.31 
 
 
638 aa  143  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  26.31 
 
 
638 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  26.19 
 
 
635 aa  143  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0587  peptidoglycan glycosyltransferase  26.86 
 
 
719 aa  143  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1498  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 
708 aa  143  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 
737 aa  143  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.4 
 
 
673 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.99 
 
 
644 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.38 
 
 
583 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  26.13 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  26.13 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  26.13 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  26.13 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  26.46 
 
 
621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  25.42 
 
 
652 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>