More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4044 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 310 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  91.29 
 
 		 310 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  63.37 
 
 		 307 aa  397  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  59.87 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  56.72 
 
 		 304 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  57.76 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 		 349 aa  311  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  56.15 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  56.52 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  54.33 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  52.32 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.69 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  50.8 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  52.61 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  49.83 
 
 		 494 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  45.25 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  47.68 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  45.86 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  45.2 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  42.07 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  44.7 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  39.27 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  40.23 
 
 		 270 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.48 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  36.48 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  42.57 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  48.17 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  35.02 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  52.94 
 
 		 350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  44.83 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  43.67 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  45.32 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  38.25 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  50.43 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  42.95 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  47.2 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.24 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  39.49 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  39.19 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  41.94 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  35.16 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  47.01 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  35.81 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  32.23 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  40.16 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>