More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2449 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 359 aa  726    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  76.26 
 
 		 358 aa  535  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  59.1 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  55.99 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 355 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  59.02 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 356 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  53.76 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  53.76 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  53.76 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  53.91 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  53.76 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  53.76 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 		 355 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  59.22 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 363 aa  391  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  51.81 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  51.81 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  54.32 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0723  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.905014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 361 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>