More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2305 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2305  amino acid permease-associated region  100 
 
 
417 aa  808    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  70.42 
 
 
410 aa  584  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  51.31 
 
 
427 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 
494 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.16 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  30.96 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  31 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  29.17 
 
 
467 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  29.17 
 
 
467 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 
476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 
458 aa  147  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
495 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.17 
 
 
467 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.17 
 
 
467 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.17 
 
 
467 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.95 
 
 
467 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.95 
 
 
467 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 
538 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.28 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.41 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 
481 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 
476 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 
490 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.51 
 
 
467 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
467 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 
500 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.53 
 
 
489 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.34 
 
 
476 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 
456 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
496 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  29.54 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.07 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.07 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.07 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 
518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.53 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 
471 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 
471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  28.29 
 
 
471 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  28.96 
 
 
466 aa  129  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 
463 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27.85 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  28.79 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
466 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.29 
 
 
468 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
466 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
468 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
468 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.27 
 
 
467 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.27 
 
 
467 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.27 
 
 
467 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  28.34 
 
 
471 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.27 
 
 
467 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 
476 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  27 
 
 
478 aa  126  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  26.17 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  26.17 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.93 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  26.17 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.7 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.7 
 
 
471 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.7 
 
 
471 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.7 
 
 
471 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.7 
 
 
471 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  29.62 
 
 
486 aa  126  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.7 
 
 
471 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.4 
 
 
467 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  29.62 
 
 
486 aa  126  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  29.35 
 
 
753 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.75 
 
 
460 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
481 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.63 
 
 
471 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 
466 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.63 
 
 
471 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
466 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 
488 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 
491 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 
469 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 
491 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
503 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.79 
 
 
471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.79 
 
 
471 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 
499 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 
471 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 
494 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 
481 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  26.81 
 
 
542 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>