55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0653 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  43.64 
 
 		 287 aa  260  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  45.55 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  43.46 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1057  hypothetical protein  39.85 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0375  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase-like protein  38.17 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0385  hypothetical protein  38.17 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  37.72 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  36.14 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0448  hypothetical protein  29.81 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0392926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  32.72 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  27.14 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 		 583 aa  112  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00960  hypothetical protein  25.91 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0293493  normal  0.617405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  30.66 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  27.45 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 		 612 aa  92.8  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  28.17 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  27.53 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  26.06 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  27.34 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  27.97 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  25.36 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  28.21 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  27.35 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  25.36 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  25.36 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  25.6 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  27.39 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  25.68 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  26.97 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  25.68 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  25.9 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  25.51 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  25 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  24.9 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  26.97 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  24.81 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  28.34 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  27.75 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1648  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  28.1 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  24.69 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  25.1 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  24.18 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  23.27 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  23.6 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>