53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00960  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0293493  normal  0.617405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  25.86 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  24.91 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  29.15 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1057  hypothetical protein  22.56 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0375  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase-like protein  22.34 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0385  hypothetical protein  22.34 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  25.91 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0448  hypothetical protein  19.85 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0392926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  24.01 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  26.42 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  27.24 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  29.39 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  29.39 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  24.82 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  26.2 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  25.32 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  25.88 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  28.98 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  24.55 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  28.69 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  29.51 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  28.21 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  27.78 
 
 		 416 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  26.5 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  26.59 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  27.54 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  24.79 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  26.87 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  23.77 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  23.08 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  24.1 
 
 		 612 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  28.8 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  26.4 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  29.27 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1648  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  20.86 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  26.26 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  28.86 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  27.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  27.21 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  27.32 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  24.28 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  25.6 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  27.19 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>