36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0448 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0448  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0392926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1057  hypothetical protein  36.84 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0385  hypothetical protein  35.71 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0375  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase-like protein  35.71 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  29.81 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  28.89 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  27.97 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  25.68 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  20.88 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  22.8 
 
 		 289 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  29.64 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00960  hypothetical protein  19.85 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0293493  normal  0.617405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  22.64 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1648  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  21.93 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  26.21 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  22.94 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  19.12 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  17.78 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  21.34 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 		 583 aa  55.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  17.68 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  27.92 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  18.24 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  18.24 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  20.72 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  19.54 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  15.53 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  16.22 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  20.24 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  18.69 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  15.77 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  19.65 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  20.12 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  20.13 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  19.82 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  16.59 
 
 		 416 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>