More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9289 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  66.67 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  61.19 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  63.16 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  57.96 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  45.45 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.94 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  45.54 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  44.72 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  44.72 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  40.55 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 198 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  42.64 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  41.7 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  45 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 191 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  45 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 197 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.31 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  40.41 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  45.93 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  45.56 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  43.82 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  42.21 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  43.16 
 
 		 214 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  35.98 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  39.25 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  42.08 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  36.79 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  36.79 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  43.58 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  42.78 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  41.99 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  41.85 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  45.05 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  43.96 
 
 		 201 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  39.29 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  44.2 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  42.49 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  43.26 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  41.18 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  45.16 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  41.34 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  43.37 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  40.31 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  43.22 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  42.66 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  40.31 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  41.49 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  39.34 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  40.88 
 
 		 194 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  40.88 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  41.57 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  40.66 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>