155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5040 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  100 
 
 		 472 aa  923    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  27.11 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 555 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 551 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 551 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  26.51 
 
 		 551 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  26.51 
 
 		 551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  26.51 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  26.51 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  26.51 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  26.51 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  26.51 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  26.51 
 
 		 551 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  26.51 
 
 		 551 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 551 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  26.36 
 
 		 500 aa  126  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 546 aa  126  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 571 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 560 aa  107  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 562 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  25.05 
 
 		 541 aa  103  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 571 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 594 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 516 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  24.02 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  21.87 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  27.78 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  27.78 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  27.78 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  25.83 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.17 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  23.43 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.93 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  24.65 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.65 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  24.65 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.65 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.65 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.38 
 
 		 470 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  24.59 
 
 		 482 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  23.48 
 
 		 533 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  23.48 
 
 		 533 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  23.48 
 
 		 533 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  27.8 
 
 		 470 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  23.79 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  27.07 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  24.86 
 
 		 482 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.07 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.85 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  23.23 
 
 		 533 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  23.3 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  29.47 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.68 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  22.81 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  24.59 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  25.64 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 538 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.5 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.5 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.5 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.5 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  24.5 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  23.23 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 452 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  23.23 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  23.23 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  23.23 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1383  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  27.32 
 
 		 470 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  23.55 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  26.45 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 546 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  27.39 
 
 		 551 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>