More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0174 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  60 
 
 
220 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  53.66 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  52.38 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  52.38 
 
 
217 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  50 
 
 
212 aa  194  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  50.78 
 
 
218 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  50.7 
 
 
210 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  49.29 
 
 
215 aa  187  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  48.51 
 
 
208 aa  175  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.66 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  48.92 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  49.21 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  47.6 
 
 
209 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.47 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  38.97 
 
 
200 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  37.26 
 
 
400 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
228 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  51.28 
 
 
121 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  37.35 
 
 
200 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.41 
 
 
224 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  34.24 
 
 
219 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  34.23 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  34.9 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.67 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  30.2 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.1 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.51 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  25.27 
 
 
390 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.38 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  31.69 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.42 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.51 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 
319 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.38 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.67 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.12 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.86 
 
 
249 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
291 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.69 
 
 
309 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
307 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  34.19 
 
 
254 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.73 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  31.36 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
296 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
1106 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  28.44 
 
 
252 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  34.81 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  30.91 
 
 
275 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 
253 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
309 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  31.88 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
264 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.52 
 
 
206 aa  58.5  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  34.35 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
364 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  27.92 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  30.1 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.16 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  31.97 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  26.98 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>