More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4830 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 363 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  68.23 
 
 		 366 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  32.59 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.21 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.75 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  28.39 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.85 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.85 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.39 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.61 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  26.46 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  28.3 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 		 358 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  24.83 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.77 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  23.61 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  23.77 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  25.38 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  26.75 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.54 
 
 		 779 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.29 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  23.24 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.53 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.84 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  26.05 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.81 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  25.14 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  30.24 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  26.67 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  22.85 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.29 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.83 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  24.49 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  23.81 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  36.5 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.46 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.08 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.23 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.1 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.96 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.92 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.61 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  24.05 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.83 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.18 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  36.36 
 
 		 574 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  25.08 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.16 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.05 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.72 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  25.16 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.77 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.72 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.38 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.72 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.72 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  25.15 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.16 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>