54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2876 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  88.89 
 
 		 171 aa  309  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  36.6 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  31.76 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  31.76 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  31.76 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  31.76 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  32.43 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  31.76 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  32.03 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  31.76 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  32.21 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.07 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  29.07 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  29.07 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  29.07 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  29.07 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  29.07 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  28.57 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  29.07 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.37 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  28.85 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  28.85 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  28.85 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  28.85 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.89 
 
 		 210 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30.48 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  28 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  30.46 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  30.46 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  31.13 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  30.46 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  31.13 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.15 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.15 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.15 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27.15 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  31.63 
 
 		 96 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  26.17 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  26.17 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  26.17 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  26.17 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  28.68 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  30.43 
 
 		 319 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  25.95 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  29.46 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  28.57 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  29.84 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  29.84 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  25.52 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  29.46 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>