295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2766 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  77.12 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  77.12 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  77.12 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  66.94 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  66.94 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  69.64 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  69.64 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  69.64 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  68.91 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  69.64 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  52.54 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  50.82 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  42.15 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  40.52 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  38.79 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  37.17 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  36.15 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  34.45 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  33.61 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  33.61 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  32.77 
 
 		 120 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  31.93 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  31.93 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  32.35 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  32.56 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  36.19 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  36.19 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  33.94 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  35.34 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  34.38 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  31.63 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  26.92 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  25.47 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  25.47 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  29.29 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.37 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  32.29 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  29.46 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.37 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  27.96 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  28.83 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  28.83 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  32.73 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  32.29 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  30.85 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  31.82 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  27 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  27.84 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  31.82 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  28.85 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  31.82 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0476  small multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.651583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  27.96 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  25 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  34.04 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  34.04 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  34.04 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  34.04 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  34.04 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  29.29 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  34.04 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>