278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001962 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  100 
 
 		 134 aa  265  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  73.48 
 
 		 125 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  55.14 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  46.43 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  44.72 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  45.54 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  44.72 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  44.72 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  48.67 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  45.54 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  40.52 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  42.98 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  37.93 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  36.29 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  36.29 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  38.1 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  36.22 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  37.82 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  47.62 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  32.46 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  31.58 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  33.85 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  30.7 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  40.82 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  31.58 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  30.7 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  30.7 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  38 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  29.84 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  37.89 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.23 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.23 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36.27 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  34.34 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  29.17 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  30.09 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3716  small multidrug resistance protein  25.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  29.25 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  32.63 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  39.36 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.14 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  29.41 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.14 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  38.04 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  32.35 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  29.29 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  37.76 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>